Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms