Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hmg20aQ9DC33 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hmg20aQ9DC33 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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