Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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