Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrn2Q9DBR1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrn2Q9DBR1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms