Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms