Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp12Q9D9M2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms