Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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