Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn22Q9D7U6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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