Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rep15Q9D7T1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms