Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmigd1Q9D7L8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms