Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nop56Q9D6Z1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nop56Q9D6Z1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nop56Q9D6Z1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nop56Q9D6Z1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms