Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms