Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ube2cQ9D1C1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms