Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms