Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms