Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms