Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms