Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msmo1Q9CRA4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msmo1Q9CRA4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msmo1Q9CRA4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msmo1Q9CRA4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Msmo1Q9CRA4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msmo1Q9CRA4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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