Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ifitm3Q9CQW9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifitm3Q9CQW9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms