Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp5f1Q9CQQ7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp5f1Q9CQQ7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms