Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
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