Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms