Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rpl17Q9CPR4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rpl17Q9CPR4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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