Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms