Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b1Q99NB9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms