Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms