Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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