Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins4Q99LZ3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms