Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nus1Q99LJ8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms