Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lactb2Q99KR3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lactb2Q99KR3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms