Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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