Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms