Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms