Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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