Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ctu1Q99J10 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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