Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfdQ925I7 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms