Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms