Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dkk4Q8VEJ3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dkk4Q8VEJ3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms