Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms