Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrkQ8VDU5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrkQ8VDU5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms