Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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