Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Hoxc12Q8K5B8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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