Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms