Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Afg3l2Q8JZQ2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Afg3l2Q8JZQ2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Afg3l2Q8JZQ2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Afg3l2Q8JZQ2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Afg3l2Q8JZQ2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l2Q8JZQ2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms