Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Neurl3Q8CJC5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms