Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Brf1Q8CFK2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Brf1Q8CFK2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Brf1Q8CFK2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf1Q8CFK2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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