Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms