Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms