Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC21

Ttc19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc19Q8CC21 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc19Q8CC21 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms