Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf170Q8CBG9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf170Q8CBG9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rnf170Q8CBG9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rnf170Q8CBG9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rnf170Q8CBG9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rnf170Q8CBG9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rnf170Q8CBG9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf170Q8CBG9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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